中华人民共和国国家出入境检验检疫局组建于1998年3月，系根据国务院机构改革方案，由原国家进出口商品检验局、原农业部动植 物检疫局和原卫生部卫生检疫局合并组建而成，为副部级政府部门。2001年4月经国务院决定国家质量技术监督局与国家出入境检验检疫局合并，组建中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局（正部级，简称国家质检总局）。 但出入境检验检疫局作为相对独立的机构其职能并没有改变。
出入境检验检疫局是主管出入境卫生检疫、动植物检疫、商品检验、鉴定、认证和监督管理的行政执法机构，主要职责是：
（一）研究拟定有关出入境卫生检疫、动植物检疫及进出口商品 检验法律、法规和政策规定的实施细则、办法及工作规程，督促检查 出入境检验检疫机构贯彻执行。
（二）组织实施出入境检验检疫、鉴定和监督管理；负责国家实 行进口许可制度的民用商品入境验证管理；组织进出口商品检验检疫 的前期监督和后续管理。
（三）组织实施出入境卫生检疫、传染病监测和卫生监督；组织 实施出入境动植物检疫和监督管理；负责进出口食品卫生、质量的检 验、监督和管理工作。
（四）组织实施进出口商品法定检验；组织管理进出口商品鉴定 和外商投资财产鉴定；审查批准法定检验商品的免验和组织办理复验。
（五）组织对进出口食品及其生产单位的卫生注册登记及对外注 册管理；管理出入境检验检疫标志、进口安全质量许可、出口质量许 可并负责监督检查；管理和组织实施与进出口有关的质量认证认可工 作。
（六）负责涉外检验检疫和鉴定机构（含中外合资、合作的检验、 鉴定机构）的审核认可并依法进行监督。
（七）负责商品普惠制原产地证和一般原产地证的签证管理。
（八）负责管理出入境检验检疫业务的统计工作和国外疫情的收 集和分析，提供信息指导和咨询。
（九）拟定出入境检验检疫科技发展规划；组织有关科研和技术 引进工作；收集和提供检验检疫技术情报。
（十）垂直管理出入境检验检疫机构。
（十一）开展有关出入境检验检疫方面的国际合作与技术交流， 按规定承担技术性贸易壁垒和检疫协议的实施工作，执行有关协议。
（十二）承办国务院及海关总署交办的其他事项。
