备手册：接到新订单后，首先要计算出这批订单所需进口资财（Material List），按照损耗计算出实际的定购量，将各类资财分类合并（按照材质相同，单价相近的原则），最后整理出来的进出口重量差额要控制在10% 以内（行业不同，损耗不同）。
网上预录入
第1步完成后，在海关的加工贸易网里面将此手册下的内容一一录入。
手册审核
第2步完成后，可以直接打印出加工贸易业务批准证申请表，进口料件/出口成品备案清单，成品对应料件单耗情况和其它申请资料一并带齐交于海关待批准。
进口
一般一周后，我们就可以拿到海关批准的加工贸易备案手册（有一个新的手册号，进料加工类以C开头），这时这本手册就生效了，我们可以按照手册来进口了。进口后，要及时将进口报关单追回，退回来的有两联，白色的为进口付汇专用联，红色的为进料加工专用，白色的要转给财务申报税务和进口付汇，红色妥善保存以备核销。
出口
生产完后，对应的成品出口。注意：第4，5 步中只能在手册备案的数量内进口/如数出口，但不能超额。
手册核销
此手册项下的出口完成后，待所有的进出口报关单收齐，就可以申请手册的核销了。准备好手册，进出口报关单和手册核销情况说明，交回海关核销科待核销即可。若损耗在10% 以内，一般都可以顺利核销，超过10% 海关会要求超出部分按照进口资财中单价最高的来补进口增值税和进口关税。
核销后，此手册执行完毕。
